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當(dāng)前位置:模擬計(jì)算 ?  分子動(dòng)力學(xué) ? 

分子動(dòng)力學(xué)

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分子動(dòng)力學(xué)

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項(xiàng)目介紹

分子動(dòng)力學(xué)(Molecular Dynamics,MD)模擬是一套分子模擬方法,是研究凝聚態(tài)系統(tǒng)的有力工具。通過分子動(dòng)力學(xué)模擬,研究者得到體系原子的運(yùn)動(dòng)軌跡,可觀察到原子運(yùn)動(dòng)過程的各種微觀細(xì)節(jié)。通過對(duì)研究體系的動(dòng)態(tài)模擬,我們能夠在分子水平上理解生物大分子的運(yùn)動(dòng)與生物功能、蛋白-小分子之間相互作用機(jī)理、納米材料分子的自組裝過程。分子動(dòng)力學(xué)模擬是理論計(jì)算和實(shí)驗(yàn)方法的有力補(bǔ)充,廣泛應(yīng)用于物理、化學(xué)、材料科學(xué)和生物醫(yī)藥等領(lǐng)域。

樣品要求

1.       科研計(jì)算服務(wù)是一個(gè)探索的過程,其中存在不確定性。所有模擬計(jì)算只保證計(jì)算方法正確,至于結(jié)果是否完全符合客戶預(yù)期無法保證。

(例如,DFT所用泛函本身采用了很多近似;另外當(dāng)前的模擬方法也存在很多近似(例如OER過程的吉布斯自由能計(jì)算中會(huì)忽略掉催化劑的表面電荷富集效應(yīng)與溶劑效應(yīng)等),這 都有可能導(dǎo)致計(jì)算結(jié)果和實(shí)驗(yàn)結(jié)果出現(xiàn)分歧(即某一問題可能是多種因素共同作用的結(jié)果,單純考慮其中某一作用不足以反應(yīng)要研究的問題本質(zhì),目前也尚未有任何計(jì)算方法可以完全實(shí)現(xiàn)模擬仿真條件與真實(shí)實(shí)驗(yàn)條件的完全一致,因此研究問題的哪個(gè)方面需要由客戶最終決定),因此,我們?cè)谟?jì)算過程中會(huì)盡可能減少可以避免的誤差,但是有些誤差受限于理論本身,不可避免,我們對(duì)此引發(fā)的后果不承擔(dān)任何責(zé)任。此外,分子力學(xué)或者分子動(dòng)力學(xué)等基于分子力場(chǎng)的模擬計(jì)算重現(xiàn)性可能不如第一性原理計(jì)算,因此不保證兩次獨(dú)立的相同體系相同任務(wù)的模擬可以得到完全定量一致的結(jié)果,對(duì)此引發(fā)的分歧,我們不承擔(dān)任何責(zé)任)。

2.       請(qǐng)?zhí)峁╆P(guān)于結(jié)構(gòu)或者實(shí)驗(yàn)條件盡可能詳細(xì)的信息

比如材料中是否有缺陷,空位,是異質(zhì)結(jié),還是負(fù)載團(tuán)簇模型等。如果不提供影響計(jì)算的關(guān)鍵信息,計(jì)算老師按著自己的理解去計(jì)算,由此導(dǎo)致的結(jié)果和費(fèi)用,請(qǐng)客戶自行承擔(dān)。

3.       原始數(shù)據(jù)保存6個(gè)月。

由于超算平臺(tái)的數(shù)據(jù)吞吐量較大,因此原始數(shù)據(jù)我們無償為客戶保存6個(gè)月,超過6個(gè)月的原始數(shù)據(jù)將會(huì)被刪除,請(qǐng)客戶知曉。且在6個(gè)月內(nèi)只提供原始數(shù)據(jù),不再接受其他相關(guān)請(qǐng)求。

4.       嚴(yán)格按照計(jì)算方案約定計(jì)算

除本方案約定內(nèi)容之外,客戶如有其他特殊需求,請(qǐng)?zhí)崆案嬷H绻枰a(bǔ)充計(jì)算可以補(bǔ)充下單。本著學(xué)術(shù)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膽B(tài)度,我們無法接受“人為調(diào)一下結(jié)果”,“調(diào)下參數(shù)使之更靠近我的預(yù)期”此類要求,所有計(jì)算結(jié)果尊重原始結(jié)果數(shù)據(jù),敬請(qǐng)客戶不要提出這種要求。如果客戶下單后,又提出此類要求,我們有權(quán)利退單,由此造成的機(jī)時(shí)浪費(fèi)及經(jīng)濟(jì)損失由客戶承擔(dān)。

5.       客戶如對(duì)計(jì)算結(jié)果有異議,可以申請(qǐng)復(fù)核

復(fù)核僅僅檢查“計(jì)算方法是否存在錯(cuò)誤”,“計(jì)算參數(shù)是否不合理”,“數(shù)據(jù)導(dǎo)入過程是否存在失誤”等問題,如果上述檢查均沒有問題,則認(rèn)定計(jì)算結(jié)果不存在理論上的錯(cuò)誤,這種情況下,不接受任何無償性質(zhì)的計(jì)算測(cè)試以及重新計(jì)算要求,請(qǐng)客戶知曉!

項(xiàng)目案例

擴(kuò)散

離子形成過程

分子對(duì)接

自組裝

拉伸

分子動(dòng)力學(xué)

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安心測(cè)服務(wù)說明
關(guān)閉
7天無理由
7天無理由免費(fèi)復(fù)測(cè)
1. 復(fù)測(cè)保證

如果在訂單完成之后7天內(nèi)對(duì)結(jié)果存疑,可申請(qǐng)同條件免費(fèi)復(fù)測(cè),更換條件或者參數(shù)不能參與免費(fèi)復(fù)測(cè)保障服務(wù),全程由專業(yè)團(tuán)隊(duì)操作,確保結(jié)果有效性;

2. 具體細(xì)則

每單限1次復(fù)測(cè)機(jī)會(huì),單次需小于5個(gè)樣品; 此外免費(fèi)復(fù)測(cè)樣品必須為同一樣,私人定制、云視頻測(cè)試不可享受此服務(wù);

3. 注意事項(xiàng)

如果由于您自身樣品的情況(樣品有問題/選錯(cuò)測(cè)試條件等)將不可享受此服務(wù);

我知道了
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